El 19 de julio de 1903, el Presidente de la Comisión, Eduardo Saavedra, escribe al Ministro comunicándole que Gómez-Moreno había terminado de catalogar las provincias de Ávila y Salamanca con enorme éxito por lo que propone que su autor siga catalogando las provincias del Norte, continuando inmediatamente con la de Zamora y con las mismas condiciones de plazos y dinero que le habían concedido en las dos anteriores. Efectivamente, el Rey firma la R.O. con el nombramiento el 21 de octubre de1903, señalando que lo debía realizar en 12 meses y que se le asignará una cantidad de dinero oportunamente. Pero esto último no llegaba y el Presidente escribe al Ministro el 27 de enero de 1904 diciendo que tenga en cuenta que ya han entrado en ejercicio los presupuestos del año y que recuerde que hay que fijar la retribución de D. Manuel. No será hasta el 19 de febrero cuando le asignen 800 pts. mensuales. Pero los problemas económicos de D. Manuel no terminan aquí. Sólo le pagaron seis meses, por lo que Saavedra escribe de nuevo al Ministro el 21 de marzo de 1905 solicitando el informe de haber entregado parte del trabajo para que le paguen los otros seis.

Una carta muy curiosa es la que escribe Gómez-Moreno al Subsecretario el 28 de mayo de 1905, pues revela en parte la relación entre ambos con vistas a la publicación del Catálogo. En ella don Manuel contesta a un oficio del día 27 en el que le solicitaban las fotografías del Catálogo y la lista de pueblos no visitados y él les recuerda que, al encargarse de la provincia, se convino verbalmente entre la editorial y el presidente de la Comisión, que aquella haría las fotografías, por no alcanzarle el dinero y porque siempre serían de más calidad las de un profesional. Añade que si esto no se hiciese así tendría que recorrer de nuevo la provincia “lo cual no es equitativo ni es posible hacer”. No sabemos cómo terminaría este intercambio de opiniones, pero el original de la provincia de Zamora consta de un volumen de texto y sólo uno de fotografías, cuando D. Manuel solía presentar dos.

El informe de la Comisión, emitido el 19 de diciembre, es sumamente parco en palabras aprobando el contenido y solicitando que le paguen los seis meses que le deben. El 10 de abril de 1906 el Catálogo es remitido al Ministerio excusando la tardanza por el hecho de que había que encuadernar el original de manera adecuada. Se hace constar que la Comisión ha encontrado en este trabajo un mérito tanto o más relevante que en los anteriores del autor. El interés que despertaban estos catálogos se hace patente en el hecho de que, a menudo, otros investigadores solicitan consultarlos. En el caso de Zamora, A. Briard, Ministro de Negocios Extranjeros de Francia pide el 22 de junio de 1906, no ya consultar, sino una copia completa para que figure en la Biblioteca Nacional de París, pero se le niega al no estar publicado.